Skype набирает популарность во всем мире. То что у Skype закрытый код и хорошая степень защиты кода можно объяснить. Skype уже давно не мелкая компания, и они зарабатывают деньги благодаря их пользователям, предоставляя сервис. Чем меньше проблем возникает с качеством сервиса - тем лучше для компании - их рейтинг ростет, привлекаются новые пользователи. Зашита кода способствует ограничить своих пользователей от потенциальных атак третими лицами. Да, Skype потенциально может воспользоваться "властью над всеми компьютерами на которых установлен Skype", и на это всегда будут тыкать хакеры которые только и ищют соц. поддержку их точки зрения для получения доступа к сети Skype. Самой компании Skype, имеея стабильный доход от своих пользователей, просто нет смысла делать какие-либо вредоностные действия. Они вышли на другой уровень. Это бизнесс.