SMD формату по барабану сколько в модели полигонов, это переходной формат. Другое дело, если в модели болше 10000 вершин, в MDL ее одним куском не скомпилируешь. Если речь идет о статической модели (без анимации), ее можно порезать на части, а в qc добавить следующие строки:
$model "body"...